邦訳資料
World Health Oranizationの記事
令和６年１１月 ６日作成
邦訳
EG.5とその下位系列に対するリスク評価の更新、2023年11月21日
Updated Risk Evaluation for EG.5 and its sublineages, 21 November 2023
要約
SARS-CoV-2 EG.5ウイルスは現在、世界的に流行しているSARS-CoV-2 の変異型の半分以上（51％）を占めている。EG.5 の下位系統であるHK.3 と HV.1 は、同時に流行している変異型と比較して高い増加優位性（growth advantage）を持っている。しかし、それらに関連する公衆衛生上のリスクは、世界レベルでは低いと分類されている。現在のエビデンスによれば、これらの表現型（phenotype）は、過去10ヵ月間、同時に流行していた他のXBB変異体とほぼ同じである。
EG.5とその下位系列に対するリスク評価の更新、2023年11月21日
EG.5はXBB.1.9.2の子孫系統で、スパイク蛋白質にF456Lのアミノ酸変異が追加されている。EG.5は2023年2月17日に初めて報告され、2023年7月19日に監視対象変異体（VUM：variant under monitoring）に指定された。2023年8月9日、WHOはEG.5の最初のリスク評価を発表し、EG.5とその下位系統を要注意変異体（VOI：variant of interest）に指定した。2023年9月21日、EG.5の最新のリスク評価が発表された。この最新のリスク評価は、以前に発表されたEG.5とその子孫系統のリスク評価に置き換わるものである。
表1：SARS-CoV-2変異体の世界的な割合（2023年第40週から第44週まで）
| 系統 | 国§ | 配列§ | 2023-40 | 2023-41 | 2023-42 | 2023-43 | 2023-44 |
| VOIs（要注意変異体） | |||||||
| XBB.1.5* | 128 | 308,614 | 8.5 | 8.2 | 8.3 | 7.2 | 8.3 |
| XBB.1.16* | 117 | 94,914 | 15.9 | 14.0 | 12.4 | 9.8 | 8.2 |
| EG.5* | 89 | 104,423 | 47.0 | 50.2 | 50.9 | 51.9 | 51.6 |
| BA.2.86* | 41 | 3,109 | 1.8 | 2.8 | 4.1 | 6.4 | 8.9 |
| VUMs（監視対象変異体） | |||||||
| DV.7* | 38 | 3,887 | 1.8 | 1.8 | 1.7 | 1.9 | 1.9 |
| XBB* | 142 | 88,309 | 3.4 | 2.9 | 2.7 | 2.8 | 2.3 |
| XBB.1.9.1* | 118 | 80,383 | 9.5 | 8.0 | 8.0 | 7.0 | 6.4 |
| XBB.1.9.2* | 95 | 36,685 | 2.4 | 2.3 | 1.8 | 2.1 | 1.9 |
| XBB.2.3* | 104 | 31,394 | 6.0 | 5.6 | 5.2 | 4.9 | 3.7 |
| Unassigned | 95 | 152,256 | 0.5 | 1.4 | 2.5 | 3.6 | 4.5 |
| Other+ | 211 | 6,785,691 | 3.0 | 2.6 | 2.3 | 2.2 | 2.2 |
EG.5 の遺伝子配列で最も多いのはアメリカ合衆国（24.8%、27,044 件）、カナダ（12.6%、13,678 件）、中国（10.6%、11,489 件）である。1,000件以上の配列を持つその他の国は、日本（7.0%、7,571件）、韓国（6.3%、6,880件）、英国（6.3%、6,803件）、フランス（5.5%、5,950件）、スペイン（4.0%、4,363件）、シンガポール（2.7%、2,946件）、スウェーデン（2. 4％、2,605件）、オーストラリア（2.0％、2,207件）、イタリア（1.9％、2,037件）、デンマーク（1.4％、1,530件）、ベルギー（1.2％、1,289件）、ドイツ（1.2％、1,272件）、オランダ（1.0％、1,117件）、ニュージーランド（0.9％、1,028件）であった。
EG.5の子孫系統の中で、下位変異体であるHV.1、HK.3、EG.5.1.1、JG.3は、疫学調査第44週におけるSARS-CoV-2 の遺伝子配列の世界的な割合の33.2％を占めている(1)。HV.1 の遺伝子配列の大部分はアメリカ合衆国（5,550件；48.0％）であり、HK.3とEG.5.1.1の遺伝子配列は主に中国（それぞれ3,049件；23.7％、6,544件；21.1％）である。 JG.3の遺伝子配列のほとんどはカナダ（371件、14.9％）である。疫学調査第40週から第44週の間に、HV.1、HK.3、JG.3の有病率（prevalence）はそれぞれ7.9％から15.1％、8.5％から12.0％、1.4％から5.2％に増加したが、EG.5.1.1の有病率は10.0％から6.0％に減少した。以下の表2は、スパイク蛋白とその他の蛋白におけるEG.5に対するHV.1、HK.3、EG.5.1.1、JG.3の新たな突然変異を示している。
表2：EG.5の子孫系統と突然変異
| 変異体 | 親系統 |
EG.5に関する スパイク蛋白の新たな突然変異 |
EG.5に関連する 他の蛋白質の新たな突然変異 |
| EG.5 | XBB.1.9.2 | NA | NA |
| HV.1 | EG.5.1.6 | S:Q52H, S:F157L, S:L452R | ORF1a:S1857L |
| HK.3 | EG.5.1.1 | S:Q52H, S:L455F | ORF1b:D54N |
| EG.5.1.1 | EG.5.1 | S:Q52H | ORF1b:D54N |
| JG.3 | EG.5.1.3 | S:Q52H, S:L455F, S:S704L | ORF1a:R542C, ORF1a:T2274I |
入手可能な証拠に基づき、EG.5 がもたらす公衆衛生上のリスクは、世界レベルでは低いと評価されている。EG.5は、現在流行している他の変異体と比較して、有病率（prevalence）、増加優位性（growth advantage）、免疫逃避性（immune escape）の増加を示していますが、現在までのところ、疾患の重症度の変化は報告されていない。 EG.5とCOVID-19による入院の割合が同時に増加している国もあるが、これらの入院とEG.5との間に直接的な相関関係は認められておらず、現在の入院は以前の流行と比較して少ない。しかし、EG.5はその増加優位性（growth advantage）と免疫逃避特性により、発症率の上昇を引き起こし、世界的に最も流行している変異体となっている。
WHOとSARS-CoV-2 の進化に関する技術諮問グループ(TAG-VE：Technical Advisory Group on SARS-CoV-2 Evolution)は、EG.5の抗体逃避（antibody escape）と重症度に関する不確実性に対処するため、加盟国に対し、特定の研究を優先するよう引き続き勧告している。提案されたスケジュールは推定であり、各国の能力によって変化する：
- 罹患地域を代表するヒト血清と、EG.5およびHV.1やHK.3など増加（growth）が最も速い下位系統の生ウイルス分離株を用いて中和アッセイを実施する（2～4週間、過去に実施された研究の結果は下表を参照のこと）。
- ローリングまたはアドホックな重症度指標の変化を検出するために、比較評価を行う（4～12週間、過去に実施された研究の結果は下表を参照）。
WHOとそのCOVID-19ワクチン組成に関する技術諮問グループ（TAG-CO-VAC：Technical Advisory Group on COVID-19 Vaccine Composition）は、ワクチン組成の更新に関する決定に情報を提供するため、COVID-19ワクチンの性能に対する変異体の影響を定期的に評価し続けている(2)。
以下のリスク評価は、現在入手可能な証拠に基づいており、より多くの証拠や さらに多くの国のデータが入手可能になれば、定期的に修正される。
|
総合的なリスク評価： 低い |
EG.5とその下位系統は世界的に広がっており、EG.5の有病率（prevalence）が上昇しているいくつかの国では、症例数と入院数が増加している。しかし、現時点では、他のオミクロン下位系統と比較して、EG.5に直接関連する疾患の重症度が増加したという証拠はなく、したがって、入手可能な証拠は、EG.5がさらなる公衆衛生上のリスクを有することを示唆していない。しかし、HK.3やHV.1といった新たなEG.5の下位変異体がもたらすリスクをより包括的に評価するためには、このリスク評価で概説した追加データが必要である。 | ||
| 使用指標 | 証拠 | リスク度 |
信頼度 |
|
増加優位性 Growth advantage |
疫学調査第40週（2023年10月2日～10月8日）と第44週（10月30日～11月5日）を比較すると、他の流行している変異体に対するEG.5の世界的な割合は顕著な増加を示し、47.0％から51.6％に上昇した。同様に、EG.5 の遺伝子配列の割合が最も高い国々では、これらの国々における EG.5 の有病率（prevalence）は、アメリカ合衆国では 40.1%から 48.1%、カナダでは 50.5%から 60.9%、中国では 92.2%から 98.2%に上昇した。
WHO内部での変異体増加率分析（variant growth rate analysis）によれば、その手法は英国保健安全保障局（UK HSA：United Kingdom Health Security Agency）が用いている手法と類似しており、EG.5とその子孫系統は、現在世界的に流行している変異体の中で最も早く増加（fastest growth）しており、ヨーロッパと西太平洋地域でも増加している(3,4)。
UK HSAは、EG.5.1.1が国内で最も高い増加率（growth rate）を示していると推定しており、2023年10月27日時点の推定有病率（prevalence）は7.4％（95％信頼区間[CI]：5.5-9.9）であるとした(5)。
米国疾病管理予防センター（US CDC：Centers for Disease Control and Prevention）のナウキャスト（Nowcast）モデルに基づく予測では、EG.5とその子孫系統の全国的な増加が引き続き予測されている；2023年10月29日から11月11日の間に、HV.1の有病率は29.0％、EG.5の有病率は21.7％と予測されている(6)。
感染性に関しては、EG.5.1とXBB.1.5の間で感染性とウイルスの親和性（tropism：ウイルスと宿主細胞との関係）に若干の違いがあることが同試験で明らかになった；XBB.1.5（感染率56％）と比較して、わずかに高い感染有効性がEG.5.1（ハムスター6匹中5匹：83％）で認められ、EG.5.1曝露動物のほとんど（曝露動物6匹中4匹：67％）が肺（および鼻腔サンプル）でウイルスを検出した。 それに対し、XBB.1.5に暴露された動物は鼻腔サンプルにおいてのみウイルスが検出された(7)。
* 詳しくは脚注を参照 |
高い | 高い |
|
抗体逃避 Antibody escape |
EG.5には変異F456Lがあり、これは多くのクラス-1 mABの受容体結合ドメインを指向するエピトープ内に位置し、抗体逃避を予測させる。
EG.5.1は、XBB.1.5と比較して、BQ.1またはXBBブレークスルー感染者の血清中和に対する抵抗性が、わずかではあるが有意に（1.3〜2倍）増加した(8-11)。 しかし、生ウイルス中和ではこの差は見られず、中和力価はXBB.1と同等であった(12)。
シュードウイルスを用いた場合、HK.3（すなわちXBB.1.5＋S:L455F）に対するすべてのBTI血清の50％中和力価（NT50）は、親ウイルスであるXBB.1.5に対するものよりも低く、HK.3に対するEG.5.1 BTI血清のNT50は、やはりEG.5.1に対するものよりも低かった。 このことから、HK.3の有病率の増加は、その免疫回避特性に起因している可能性が示唆された(7)。
** 詳しくは脚注を参照。 |
中程度 | 中程度 |
|
重症度と臨床的／診断的考察 Severity and clinical/diagnostic considerations |
現在のところ、他のオミクロン下位系統と比較して、EG.5によって病気の重症度が上昇したという報告はない。シリアンハムスターを用いた実験室ベースの研究では、XBB.1.5とEG.5.1の間で増殖（growth）能力や病原性に明らかな違いはないと報告されている(7)。
シンガポールで行われた研究の最新版では、EG.5感染症の重症度に、他のXBB子孫系統の感染症との差はないと報告されている（13）。
別の最近の研究では、ハムスターにおけるSARS-CoV-2亜種の病原性を表現する（phenotype）ことを目的とし、EG.5.1の病原性はBA.2.75と同等であったが、BA.1より有意に高いことが観察された(14)。この結果がヒトでの感染にどのように反映されるかは不明であり、現在のところこの方向を示す疫学的データはない。
これらの違いを確認し、その要因を特定するためには、さらなる評価が必要である。
最も多く報告された変異型がEG.5であったいくつかの国では、症例の増加に続いて入院患者数の増加が観察された。 しかし、検査量の減少、検査戦略の転換、報告の遅れなど、ヒトの症例に対するサーベイランス活動が減少しているため、観察された傾向はすべて慎重に解釈されるべきである。
*** 詳しくは脚注を参照。 |
低い | 低い |
付録：
* 増加優位性（Growth advantage）
リスク度：高い。 この変異型は、WHOのいくつかの地域で最も急速に増加している変異体であり、世界的にも急速に有病率（prevalence）が増加しているからである。EG.5の最初のリスク評価が2023年8月9日に発表されて以来、この変異体は、長期にわたって安定した増加率を維持し、世界的に支配的な変異体となっている。
信頼性： 高い。いくつかの専門家グループによって、またいくつかの国やWHOの地域によって、増加優位性が推定されているため、信頼性は高い。現在、EG.5とその下位系統は、世界中でGISADに提出された遺伝子配列の50％以上を占めている。
** 抗体逃避（Antibody escape）
危険度：中程度。XBB.1.5中和抗体の免疫逃避によるもので、以前は50％以上の有病率のピークを示した世界的に支配的な変異体であった。
信頼性：中程度。免疫逃避の結果は、生ウイルスを使用した研究室も含め、複数の研究室からの研究結果に基づいている。
*** 重症度と臨床的考察
危険度：低い。現在のところ、この変異型に関連して疾患の重症度が上昇したという報告はない。
信頼性：低い。WHOの全地域担当者、各国およびパートナー間で定期的な調整とデータ共有が行われているが、新規入院およびICUデータのWHOへの報告は大幅に減少しているため、報告の減少による重症例の解釈には注意が必要である。実験室におけるウイルスの親和性（tropism：ウイルスとそれが増殖する宿主細胞との関係）の特徴については、さらなる研究が必要である。というのも、シリアンハムスターでは、（XBB.1.5との）微妙な違いを報告した研究が1件あるだけで、その結果の意義は不明だからである。この変異型が臨床結果に及ぼす影響をさらに評価するためには、ヒトを対象とした新たな研究が必要であろう。
参考文献
1. CovSPECTRUM.
https://cov-spectrum.org/explore/World/AllSamples/AllTimes/variants?nextcladePangoLineage=EG.5*&
(accessed on 06 October 2023)
2. World Health Organization Technical Advisory Group on COVID-19 Vaccine Composition. Available from:
https://www.who.int/groups/technical-advisory-group-on-covid-19-vaccine-composition-(tag-co-
vac)
(accessed on 11 September 2023)
3. CovSPECTRUM. F456L mutation. Available from:
https://cov-spectrum.org/explore/World/AllSamples/from%3D2023-08-14%26to%3D2023-09-10/variants?aaMutations=S%3A456L&
(accessed on 11 September 2023)
4. Github. Transmission Fitness Polymorphism Scanner. Available from:
https://github.com/mrc-ide/tfpscanner
(accessed on 11 September 2023)
5. UK Health Security Agency. SARS-CoV-2 genome sequence prevalence and growth rate update: 8 November 2023. Available from:
https://www.gov.uk/government/publications/sars-cov-2-genome-sequence-prevalence-and-growth-rate/sars-cov-2-genome-sequence-prevalence-and-growth-rate-update-8-november-2023
(accessed on 14November 2023)
6. US Center for Disease Control and Prevention. COVID Data Tracker. Variant Proportions. Available from:
https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions
(accessed on 14 November 2023)
7. Kosugi Y, Plianchaisuk A, Putri O, Uriu K, Kaku Y, Hinay Jr AA et al. Virological characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron HK.3 variant harboring the “FLip” substitution. bioRxiv.
2023.
https://doi.org/10.1101/2023.11.14.566985
8. Faraone JN, Qu P, Goodarzi N, et al. Immune evasion and membrane fusion of SARS-CoV-2 XBB subvariants EG.5.1 and XBB.2.3. Emerg Microbes Infect. 2023;12(2):2270069
https://doi.org/10.1080/22221751.2023.2270069
9. Wang Q, Guo Y, Zhang RM, et al. Antibody neutralisation of emerging SARS-CoV-2 subvariants: EG.5.1 and XBC.1.6. Lancet Infect Dis. 2023;
https://doi.org/10.1016/S1473-3099(23)00555-8
10. Lasrado N, Collier AY, Hachmann NP et al. Neutralization escape by SARS-CoV-2 Omicron subvariant BA.2.86. Vaccine,BioRxiv. 2023;41(47):6904-6909
https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2023.10.051
11. Hu Y, Zou J, Kurhade C, et al. Less neutralization evasion of SARS-CoV-2 BA.2.86 than XBB sublineages and CH.1.1. Emerging Microbes & Infections.2023.
https://doi.org/10.1080/22221751.2023.2271089
12. Lassauniere R, Polacek C, Utko M, Sorensen KM, Baig S, Ellegaard K et al. Virus isolation and
neutralization of SARS-CoV-2 variants BA.2.86 and EG.5.1. Lancet Infect Dis. 2023.
https://doi.org/10.1016/S1473-3099(23)00682-5
13. Pung R, Peng Kong X, Cui L, Chae S-R, Chen M, Lee VJ et al. Severity of SARS-CoV-2 Omicron XBB subvariants in Singapore. Lancet Reg Health West Pac. 2023;37:100849.
https://doi.org/10.1016/j.lanwpc.2023.100849
14. Uraki R, Kiso M, Iwatsuki-Horimoto K, et al. Characterization of an EG.5.1 clinical isolate in vitro and in vivo. BioRxiv. 2023.
https://doi.org/10.1101/2023.08.31.555819
原典
